Application de l’édition du génome à la santé en Afrique subsaharienne

Édition du génome
Cette technique permet aux chercheurs d’insérer, de supprimer ou de modifier l’ADN pour faire taire, activer ou autrement modifier la caractéristique génétique spécifique d’un organisme. La technologie peut être utilisée pour le traitement des maladies du bétail et du cancer.

L’édition du génome (également appelée édition de gènes) est un groupe de technologies qui permettent aux scientifiques de modifier l’ADN d’un organisme. Ces technologies permettent d’ajouter, de supprimer ou de modifier du matériel génétique à des endroits particuliers du génome. Plusieurs approches d’édition du génome ont été développées. Un récent est connu sous le nom de CRISPR-Cas9, qui est l’abréviation de répétitions palindromiques courtes régulièrement espacées en cluster et de la protéine 9 associée à CRISPR. Le système CRISPR- Cas9 a suscité beaucoup d’enthousiasme dans la communauté scientifique car il est plus rapide, moins cher, plus précis et plus efficace que les autres méthodes d’édition du génome existantes.

L’édition du génome humain a un grand potentiel. Il peut améliorer la santé humaine et la médecine en apportant des modifications à l’ADN dans les cellules pour corriger, introduire ou supprimer presque toutes les séquences d’ADN susceptibles de provoquer des maladies. D’autres avantages potentiels incluent de nouvelles façons de diagnostiquer, de traiter et de prévenir les troubles génétiques, de nouvelles façons de traiter l’infertilité, d’accroître les connaissances sur la biologie humaine et de contribuer au développement de vaccins.[1]

Recommandation de l’UA sur l’édition du génome

L’UA soutient la Coalition africaine pour la communication sur l’édition du génome, qui renforce les compétences et la confiance des chercheurs africains.[4]

L’AUDA-NEPAD reconnaît le rôle important que jouent la science, la technologie et l’innovation (STI) dans la progression socio-économique de l’Afrique, tel qu’il est inscrit dans l’Agenda 2063 de l’UA de l’Union africaine, qui identifie la science, la technologie et l’innovation (STI) comme des outils multifonctionnels et des catalyseurs pour atteindre les objectifs de développement du continent. Le schéma de l’UA souligne que la croissance, la compétitivité et la transformation économique soutenues de l’Afrique nécessitent des investissements continus dans les nouvelles technologies et l’innovation dans l’agriculture, la santé, l’énergie propre et l’éducation, entre autres secteurs.[2]

En 2017, l’Union africaine s’est engagée à investir dans le développement et la réglementation de la technologie de forçage génétique pour le contrôle et l’élimination du paludisme et a mené des efforts pour aider les pays membres à garantir la recherche et le développement de nouveaux outils de contrôle des vecteurs génétiques.

Travaux en cours et acteurs principaux

Actuellement, la plupart des recherches sur l’édition du génome visent à comprendre les maladies à l’aide de cellules et de modèles animaux. Les scientifiques travaillent toujours pour déterminer si cette approche est sûre et efficace pour une utilisation chez l’homme. Il est exploré dans la recherche sur une grande variété de maladies, y compris les troubles monogéniques tels que la fibrose kystique, l’hémophilie et la drépanocytose. Il est également prometteur pour le traitement et la prévention de maladies plus complexes, telles que le cancer, les maladies cardiaques, les maladies mentales et l’infection par le virus de l’immunodéficience humaine (VIH).[3]

La technologie d’édition du génome dans l’agriculture a fait de grands progrès sur le continent avec l’adoption des cultures biotechnologiques. Actuellement, il y a sept pays – Eswatini, Éthiopie, Kenya, Malawi, Nigéria, Soudan et Afrique du Sud – dans lesquels cinq cultures biotechnologiques – manioc, coton, niébé, maïs et soja – ont déjà reçu une approbation de biosécurité.

Le Centre pour la génétique et la santé du bétail tropical (CTLGH) soutient des programmes qui améliorent les moyens de subsistance basés sur l’élevage dans les tropiques. Son programme de génomique laitière vise à faciliter l’application de la génomique à la production laitière dans les tropiques pour accroître la productivité du bétail, améliorer les moyens de subsistance des ruraux pauvres, accroître la sécurité alimentaire et nutritionnelle et un développement environnemental plus durable.

Dans le domaine de la santé, le groupe de recherche African Computational Genomics (TACG) de l’unité de recherche MRC/UVRI & LSHTM à Entebbe, en Ouganda, traite une grande quantité de données génomiques, cherchant à identifier les gènes impliqués dans les

maladies rénales, cardiaques et autres, dans le but de prévenir et de traiter les maladies chez les Africains.

Le réseau d’épidémiologie génomique du paludisme (MalariaGEN) applique le séquençage du génome entier pour découvrir les différences génétiques naturelles dans les populations de moustiques à travers l’Afrique, dans le cadre d’efforts de surveillance génétique plus larges. Le programme de surveillance génomique des moustiques de MalariaGEN – également connu sous le nom d’Observatoire des vecteurs – est un réseau d’études sur la variation génétique des espèces de moustiques anophèles responsables de la transmission du paludisme. Ces études créent les plus grandes ressources de référence au monde sur les données de évariation du génome des espèces d’anophèles.

Au Nigéria, le Centre d’excellence africain pour la génomique des maladies infectieuses (ACEGID) forme des scientifiques africains en génomique pour qu’ils développe des outils d’éradication des maladies infectieuses. Depuis sa création en 2013, le centre a poursuivi des recherches basées sur la génomique sur la fièvre de Lassa, Ebola et le paludisme.

Cadres réglementaires dans les pays en Afrique subsaharienne

L’Union africaine a formulé des politiques qui créent une orientation stratégique continentale dans l’exploitation de la biotechnologie pour le développement socio-économique, et dont le principal résultat est la publication « Liberté d’innover » de 2007. Un autre effort est la Stratégie scientifique, technologique et d’innovation pour l’Afrique (STISA 2014-2024), avec la formation du Groupe africain de haut niveau sur les technologies émergentes (APET) pour l’établissement des priorités ; dont l’une des priorités est la Stratégie de forçage génétique pour l’élimination et la lutte contre le paludisme de 2018. L’AUDA exerce également un leadership en soutenant les États membres de l’UA dans les négociations internationales lors de la Conférence de la Convention sur la diversité biologique et de la Réunion des Parties au Protocole sur la biosécurité (COP-MOP) .[5]

En outre, grâce au Réseau africain d’expertise en biosécurité (ABNE), l’AUDA a bien progressé dans le renforcement des capacités de biosécurité dans la région afin de garantir une utilisation sûre et responsable de ces innovations modernes. De plus, dans un mouvement visant à renforcer la position de l’agenda de l’édition du génome, la Coalition africaine pour la communication sur l’édition du génome a été lancée. C’est un concept qui a été évoqué et recommandé lors du symposium Africa Biennial Biosciences Communication (ABBC2021), qui s’est tenu en Afrique du Sud.

Cependant, les pays africains sont en retard dans la résolution des problèmes soulevés par les technologies d’édition du génome et leur développement ultérieur en médecine pour prévenir les maladies génétiques et les risques de l’édition du génome. Un soutien réglementaire est nécessaire pour établir les meilleures pratiques en matière de biobanques, d’éthique, de partage de données et de commercialisation.

Défis liés au financement et aux cadres réglementaires
L’édition du génome connaît de nombreux problèmes allant d’une mauvaise réglementation: manque de lois, de politiques et de lignes directrices réglementaires strictes pour la

recherche scientifique et éthique; l’inexistence de garanties et de structures adéquates pour protéger la dignité et les droits des populations vulnérables.[6]

Absence de mécanismes de contrôle: capacités institutionnelles, procédurales et professionnelles pour améliorer la qualité, la sécurité et la propriété éthique de la recherche. En général, les communautés africaines disposent de structures juridiques et réglementaires limitées et sous-développées pour contrôler la recherche sur l’édition du génome et les risques potentiels pour la santé. De nombreux pays africains n’ont pas de législation et de lignes directrices pertinentes ou de règles exécutoires sur la modification génétique de la lignée germinale humaine. Les États africains manquent de cadres réglementaires appropriés – éthiques, juridiques et administratifs, pour limiter l’accomplissement des sommets inégalés de perfection, de grandeur et de puissance des technologies d’édition du génome. Il y a aussi le défi de l’insuffisance des ressources en raison de la faible priorité accordée à la science et à la technologie en Afrique subsaharienne.